برنامه راهبردی پنج ساله پژوهشکده که برای سالهای ۱۴۰۳ تا ۱۴۰۷ تهیه شده و به تصویب هیات امنا رسیده است بر اساس نیازهای روز کشور در حوزه محیط زیست و نیز برای همراه شدن با انتظارات وزارت علوم، تحقیقات و فناوری تهیه شده است.
برنامه راهبردی قبلی پژوهشکده نیز بر اساس نیازهای وقت برای سالهای ۱۳۹۷ تا ۱۴۰۲ به عنوان سند اصلی توسعه و پیشرفت پژوهشکده تهیه گردیده بود که قابل دریافت است.
پژوهشکده محیط زیست و توسعه پایدار به عنوان بازوی تحقیقاتی و سیاستگذاری پژوهشی سازمان حفاظت محیط زیست کشور، براساس موافقت قطعی شورای گسترش آموزش عالی کشور و با چهار گروه پژوهشی اقتصاد محیط زیست، ارزیابی و مخاطرات محیط زیست، تنوع زیستی و ایمنی زیستی و مهندسی محیط زیست و پایش آلایندهها در حال فعالیت است. بر اساس اساسنامه مصوب شورای گسترش آموزش عالی کشور محل فعالیت پژوهشکده در تهران بوده و در شرایط فعلی، در ضلع شمال غربی پارک پردیسان مستقر است و البته میتواند واحدهای کارگاهی در سراسر کشور داشته باشد.